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martes, 1 de noviembre de 2022

TRANSCRIBI... & TRADUCCI...

 "... ENDO"

En las células eucariotas, el ADN se encuentra "encerrado" dentro del núcleo...
... pero es el ADN responsable de la síntesis de proteínas...
... y este proceso "lo realizan" los ribosomas (asociados a las membranas del retículo endoplasmático, o no) en el citoplasma.
DEBEN "DARSE", por lo tanto, una "serie de procesos" que, de algún modo, "conecten" el ADN con las proteínas a sintetizar.
ESTOS PROCESOS se denominan... Transcripción y Traducción.
https://lh3.googleusercontent.com/proxy/dltLS1Gr1L9zRR2zeW87tnr0OyzZqDp0lxSFtLACe6d79ox1
Do9W0i82olxPbgieuNJl99N35giDTD6whQ_61ThoiM9Rsx6aXQWCthPA

¡"Vayamos" con la Transcripción!: El ADN "transmite la información" al ARN...
...  el ADN "construye" el ARN...
Transcripción genética - Wikipedia, la enciclopedia libre
https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/f/f7/DNA_transcription.jpg
 
Como sucedía en en la Replicación, el ADN se "desenrrolla" y sus cadenas "se abren"...
Pero, "en esta ocasión", sólo una de las dos cadenas va a servir "de molde" y sobre el mismo...
... se van a "ir pegando" los "nucleótidos de ARN" ¡cuya pentosa es la Ribosa!...
    
 ...y ¡¡¡NUNCA TIENEN COMO BASE: TIMINA(T)!!!... ¡¡¡TIENEN URACILO (U)!!!...   
          Siguen "uniéndose" Guanina y Citosina  y la Timina "del ADN" con la Adenina "del ARN"
  pero... ¡¡¡la Adenina "del ADN, "se combina" con el Uracilo !!!

NOTA IMPORTANTE: LA PRINCIPAL ENZIMA DEL PROCESO SE DENOMINA ARN polimerasa Y ACTÚA EN SENTIDO 5' --> 3'.
https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEif6TJ77jwODFkmvMmBthxp9l9za_LAarf1627_hMJRJWrK8A2H_JhYZDyJuPgquWaVJZr_PBd9yfj9Qo43pc6D64LuBImUBG8GcTSNwxE7V4q7UlXKW0RWjFYgoanQQyN4-DnKKB1gRHM/s1600/startrans.gif
https://2.bp.blogspot.com/-qdFbMqzNi7s/UTeYy9wnZBI/
AAAAAAAAARE/HfOtC4WZHTo/s1600/startani.gif

...Y, una vez formado (transcrito) el ARN, éste "abandona la compañía del ADN", que vuelve a "enrollarse".
El ARN "recién formado"... sale del núcleo... se dirige a la región(es) citoplasmática(s) en la que se encuentran los ribosomas y...
https://www.researchgate.net/profile/Jose_Font/publication/258243456/figure/fig6/AS:37280443746
3045@1465894912753/Figura-37-Transcripcion-de-la-informacion-genetica-del-ADN.png

... Y... tiene lugar ¡el """paso""" de ARNm a proteínas: la TRADUCCIÓN!
https://www.ciberer.es/media/1002466/img.jpg?anchor=center&mode=crop&width=735&height=325&rnd=132896920220000000
https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjcTi6raFySq_4xHKI9C8jefLjCIfJqSglwJw2vtgofGRtGtlPxhOjSOGDmz82DqkEy5SbGprRz9RUm125TIv0VG7G1oNTgNBx6KwyGLP3v2gOhgni-XoyLtPyn9jOjM9FJZwbTyFihmvA/s1600/sintesisprote.gif

¡¡¡ Busquemos, pues, "un diccionario"!!!...
Pero no un diccionario cualquiera, ya que "tenemos que pasar" de un lenguaje de "cuatro letras" (A, G, C y U) a uno de veinte (número de aminoácidos diferentes que constituyen las proteínas).
Después de "laboriosas investigaciones" (en algunas de ellas participó Severo Ochoa*) se encontró la "clave"... la "conexión ARN-proteínas"... había "nacido"  el ¡¡¡CÓDIGO GENÉTICO!!!.

*... y así (dicen) se descifró el CÓDIGO GENÉTICO

Posiblemente el "traductor" más antiguo y ¡UNIVERSAL! que existe...
https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d6/GeneticCode21-version-2.svg/800px-GeneticCode21-version-2.svg.png
Archivo:GeneticCode21-version-2.svg

Hay otras formas "más sencillas" (y fáciles de buscar en cualquier parte) de "representar el CÓDIGO GENÉTICO" pero... ésta que encontré en "la Wiki" me pareció "más artística", si es que, "en estos temas", hay cabida para algo "similar al Arte".

OTRAS FORMAS: 
de representar el código genético...

Código genético universal | Biologia molecular, Codigo genetico ...
https://i.pinimg.com/originals/a1/00/d5/a100d5b09c4f3ac4cba5ba9452545395.png

David Marín on Twitter: "La rueda del código genético lo pedía a ...
https://pbs.twimg.com/media/DrF2HOfWwAANFSY.jpg
https://genotipia.com/wp-content/uploads/2020/10/007-1.png
https://i1.wp.com/www.innovabiologia.com/wp-content/uploads/2017/06/codigo-genetico.jpg

NOTA IMPORTANTE: Los Lys, Asn, Thr, Met, Arg, etc. (que "salen" a veces") son las "abreviaturas" de los distintos aminoácidos: Lisina, Asparagina, Treonina, Metionina, Arginina, etc.

Como puede (o debería poder) "verse" cada aminoácido viene "determinado" por tres bases de nucleótidos. A estos "tríos" se les denomina TRIPLETES o CODONES
Al existir 64 "combinaciones" (de 3 bases) posibles...  cada aminoácido  puede ser determinado  (en "esta jerga"  se dice "codificado") por varios tripletes... 

En "muchos códigos genéticos" puede verse  a los tripletes UAA, UGA y UAG "codificar" para "alto", "stop", etc. queriendo decir ¡¡¡que la proteína "se ha terminado"!!! y ¡¡¡NO!!! que se añade un aminoácido llamado "alto", "stop", "silencio",...

DEBEMOS TAMBIÉN SABER QUE... los tripletes (o codones) que codifican para los diferentes aminoácidos pertenecen al ARN mensajero; ES DECIR QUE... el código genético ¡"RELACIONA" codones ARNm con aminoácidos!


¡"MANEJEMOS", el CÓDIGO GENÉTICO!
... y "empezamos" por el codon "AUG" que, al parecer, es el "punto de partida" de la TRADUCCIÓN.
Si utilizamos un "código rectangular"... 
... "empezamos" con la primera columna ("la que se encuentra más a la izquierda"...) hasta hallar la "A" (algo no demasiado difícil, pues sólo hay cuatro alternativas)...
... la segunda (letra)= U... está situada en la "fila más alta"... (sería como "jugar a los barcos"/"hundir la flota")
... conseguidas esta dos bases... "nos encontramos" con un recuadro con cuatro tripletes que, como era de esperar... empiezan todos por AU... pero sólo uno termina con G... 
... "tenemos" ya el ansiado trío AUG... y "vemos" su correspondencia con el aminoácido metionina (MET)

Si empleamos un "código circular"... 
... "iremos" desde el centro (allí elegiremos la base "A")... hacia la periferia ("U", en el "segundo círculo" y "C", en el tercero)...
... "llegando" al aminoácido buscado...

... y así... sucesivamente... por ejemplo, si después "viniese" el codón CCA... se correspondería (codificaría en esta "jerga") con/para el aminoácido prolina (PRO)...
... y sigue, y sigue... utilizando una representación del código genético (o la otra)...

... hasta llegar a uno de estos tres tripletes UAA/UGA/UAG... ¡¡¡que no codifican para aminoácido alguno!!!
... que determinan el final de una traducción... 
... de ahí lo del "STOP" (que, repito... ¡¡¡NO ES NINGÚN AMINOÁCIDO!!!)

Practicando con el "CÓDIGO":
https://biomodel.uah.es/biomodel-misc/codgen/inicio.htm


... Y DE ESTE MODO, y gracias al CÓDIGO GENÉTICO, podemos saber qué aminoácidos se corresponden con una secuencia de ARN mensajero... PERO... conocer CÓMO TIENE LUGAR LA TRADUCCIÓN es """ligeramente""" + COMPLEJO:
Los diferentes aminoácidos (han "llegado" a la célula, "transportados" por la sangre, después de "haber sido digeridas", en el tubo digestivo" las proteínas de las que "formaban parte") se encuentran dispersos por el citoplasma y necesitan "un transporte" para "llegar a" los ribosomas.
Los ARN transferentes son los encargados de "conducir" a los aminoácidos al lugar de la síntesis de proteínas.
Existen (al menos) tantos ARN transferentes diferentes como tipos de aminoácidos haya... pues ¡¡¡también "aquí y ahora"!!! hay especificidad.


Como ya hemos visto👀... 
... en el ARNm... los nucleótidos ("sus BASES NITROGENADAS")... se van agrupando de "TRES en TRES"... constituyendo los denominados tripletes o codones...
... Y CADA UNO DE ESTOS CODONES... 
... va a tener "sus correspondientes -tres bases complementarias- anticodones" en un ¡ARN transferente determinado!
Archivo:Codon-Anticodon pairing.svg - Wikipedia, la enciclopedia libre
https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6b/
Codon-Anticodon_pairing.svg/1200px-Codon-Anticodon_pairing.svg.png
GCC(codón/ARNm)===>CGG(anticodón/ARNt)
Y ese anticodón... pertenece a un ARN transferente que va a unirse, ¡¡¡EXCLUSIVAMENTE!!!, por su extremo 3', a un aminoácido determinado: en el ejemplo "que nos ocupa" el codón GCC (que en el código genético corresponde con el aminoácido Alanina -Ala-) se unirá "por complementariedad de bases" al ARNt (con el anticodón "CGG") que, en su extremo 3' lleva unido el aminoácido Alanina -Ala-.

Como puede suponerse... en todos estos procesos actúan enzimas que, para "su trabajo", requieren energía...
https://2.bp.blogspot.com/-6mHcVxhDYGY/UTUfwqffE_I/
AAAAAAAAAIk/VZBy6KiBQ2E/s240/chgtrnaa.gif

Al parecer... el primer "codón"...
"leído por los ribosomas" 
... es AUG... al que le "correspondería " un anticodón UAC, que está presente el el ARNt que "transporta" el aminoácido MET(=Metionina)...

Los ARNt y los ribosomas (artículo) | Khan Academy
https://cdn.kastatic.org/ka-perseus-images/68a058f788f7448c04bfb26f98ac06ca88a5b3ed.png
En el código genético... la relación que se establece es entre
 los codones del ARNm y los aminoácidos de las proteínas...
en el ejemplo AUG--->MET "saltándose" el ARNt

Tal vez el siguiente esquema ayude (o No) a comprender, en conjunto, el proceso...
http://institutoroche.es/web/images/figura1_ed3.gif
El ARNt viene representado únicamente  por
 los anticodones; correspondiendo los óvalos más
grandes a los aminoácidos que, cada uno, transporta

En el siguiente vídeo (musical) puede verse el proceso de traducción +/- completa/compleja... 
... es aconsejable "reducir la velocidad de reproducción", al menos la primera(as) vez(ces)...
... pueden apreciarse:
- las dos subunidades que componen los ribosomas.
- los diferentes lugares en los que se produce(n) la(s) unión(es)-desunión(es) de los codones (del ARNm) y los anticodones (de los ARN transferentes).
- el desplazamiento del ribosoma a través del ARN mensajero (¿o es ARNm el que se desplaza?)  ("translocación").

- los "movimientos" de los ARN transferentes.
- los enlaces peptídicos (¡¡¡VISTO👀 AL ESTUDIAR LAS PROTEÍNAS!!!) que se establecen entre los diferentes aminoácidos "que van llegando"...

... (imágenes) con "música"

https://4.bp.blogspot.com/-77ujzE40x5M/ViQ-9qNPUkI/AAAAA
AAAALU/hPrNMVEYbFw/s1600/trans1%2B%25281%2529.gif
https://af46520e9f.cbaul-cdnwnd.com/0249ce86957635a01d86f0b99629
5e21/200000034-439db4497f/Sintesis%20de%20Prote%C3%ADnas.gif

OTRA "peli"... "bastante clara"... aunque con "¿?algunos términos de +¿?"
https://www.youtube.com/watch?v=YoyFpumWtHo&
ab_channel=AlilaMedicalMediaenEspa%C3%B1ol

IMAGEN "FIJA"


Animaciones TRADUCCIÓN:
https://biomodel.uah.es/biomodel-misc/anim/traduc/traduc1.htm
https://biomodel.uah.es/biomodel-misc/anim/traduc/traduc2.htm
https://biomodel.uah.es/biomodel-misc/anim/traduc/traduc5.html


El video "que viene" es una representación animada de la síntesis de proteínas (es "en procariotas", pero no difiere mucho de "lo que sucede" en eucariotas)...


Resumen de "todo el proceso"

https://www.youtube.com/watch?v=gG7uCskUOrA&t=3s&ab_channel=yourgenome


En "cristiano"...


BASTANTE COMPLETO...

IMPORTANTE a partir del instante 10' 36": "... el proceso termina cuando el ribosoma alcanza un codón de terminación...no existe ningún ARNt cuyo anticodón sea complementario a cualquiera de estos codones..."


ADN ---> ARN ---> Proteínas con "The AMOEBA SISTERS"

Buena explicación de otra docente:


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